Dentro dos programas de Incentivo existentes, destacam-se:
- S.I. Inovação Produtiva;
- S.I. Empreendedorismo Qualificado e Criativo;
- S.I. I&DT, S.I. Internacionalização PME;
- S.I. Qualificação PME, SI2E;
- Vales: Empreendedorismo, Inovação, Internacionalização, I&DT.
A EFACONT coloca candidaturas nos vários programas operacionais traçados pelo Portugal 2020:
- POCI (Programa Operacional Competitividade e Internacionalização);
- POCH (Programa Operacional do Capital Humano);
- POSEUR (Programa Operacional Sustentabilidade e Eficiência no Uso de Recursos);
- POISE (Programa Operacional Inclusão Social e Emprego);
- PDR (Programa de Desenvolvimento Rural)
